Staffel 1

FOLGE 01: PROLOG + SUPER SPARTAN i

Bei einer Razzia auf ein Treffen mit einem ausländischen Vertreter, bei dem er Korruption und kriminelle Machenschaften vermutet, stößt Daisuke Aramaki von der Staatssicherheit auf den mysteriösen Cyborg Motoko Kusanagi. Sie schlägt dem Innenminister die Gründung einer neuen Spezialeinheit vor. Doch Aramaki bittet Kusanagi zuerst um eine Ermittlung.

FOLGE 02: SUPER SPARTAN ii + JUNK JUNGLE i

Nachdem Aramaki Kusanagi und ihr Team rekrutiert hat, nehmen sie ihre Arbeit als Shell-Einheit auf. Das Cyberbrain der Übersetzerin des Außenministers wurde mit einem Virus infiziert. Aramaki ahnt, dass Colonel Malles, der im Exil im Land lebt, ein geheimes Treffen sabotieren will. Er befiehlt Kusanagi, den Hackerangriff zurückzuverfolgen und den Täter zu finden.

FOLGE 03: JUNK JUNGLE ii + MEGATECH MACHINE i + ii

Kusanagi und Togusa nehmen ihren Verdächtigen nach einer rasanten Verfolgungsjagd in ihren Fuchikomas fest. Währenddessen observieren Aramaki und Batou Colonel Malles, als dieser Besuch von jemandem erhält, den sie für den Puppenspieler halten, den Hacker, der auf seinen Befehl hin den Virus freigesetzt hat.

FOLGE 04: ROBOT RONDO

Nachdem Roboter-Prototypen Menschen angreifen, spürt Kusanagis Team Roboter derselben Modellreihe auf und stellt fest, dass sie alle ein gemeinsames Merkmal aufweisen. Batou und Togusa machen sich auf zu Hanka Precision Instruments, dem Hersteller der Roboter, um herauszufinden, was hinter den Angriffen steckt.

FOLGE 05: PHANTOM FUND

Kusanagi und das Team reisen in den Hohen Norden, um einen Kampfcyborg namens Koil Krasnov zu überwachen. Um herauszufinden, was Koil im Schilde führt, und die Korruption hinter dem Ausbau der unterirdischen Fabrik von Sagawa Electronics aufzudecken, infiltriert Kusanagi die Büros von Sagawa, während Batou und die anderen sich auf den Weg zur unterirdischen Fabrik machen.

FOLGE 06: DUMB BARTER

Kusanagi und ihr Freund müssen nach einem unerwarteten Angriff ins Krankenhaus. Sie vermuten, dass Toru Soma dahintersteckt, ein Terrorist, mit dem Kusanagi bereits in der Vergangenheit zu tun hatte. Kusanagi und Togusa verlassen das Krankenhaus und liefern sich nach einer Verfolgungsjagd in einer verlassenen Fabrik einen erbitterten Kampf gegen eine bewaffnete Gruppe.

FOLGE 07: BYE BYE CLAY

Ein Roboter flieht aus der Megatech Body Co., Ltd. Sektion 9 nimmt ihn fest, muss jedoch feststellen, dass es sich um den Puppenspieler handelt. Der Puppenspieler verkündet Aramakis Team, er sei "eine Lebensform, die aus dem Meer an Informationen entstanden ist". Kurz nachdem er politisches Asyl beantragt hat, wird er von Unbekannten entführt.

Folge 8

Folge 9

Folge 10